
Представление о подводном рельефе центральной части моря, в отличие от глубин прибрежной части, продолжало оставаться крайне неудовлетворительным. Предположение о существовании между Крымом и турецким побережьем подводного порога, разделяющего
Черноморский бассейн на западную и восточную половины, дало повод русскому геологу Н. И. Андрусову, работавшему над проблемами происхождения
Черного моря и его геологической истории, задумать подробное изучение рельефа черноморского дна. В конце XIX в. по его инициативе было начато систематическое и комплексное изучение Черного моря. 30 декабря 1889 г. в Москве проходил конгресс русских естествоиспытателей и врачей. В обширном и хорошо обоснованном докладе о необходимости исследовать Черное море Андрусов в качестве самой важной задачи выдвинул задачу исследования рельефа черноморского дна. Исходя из теоретических предпосылок, он предположил, что черноморскую котловину разделяет подводное возвышение, расположенное между Крымом и Синопом, и настаивал на том, чтобы это предположение проверить.
В 1890 г. осуществилась первая глубомерная экспедиция. В ее распоряжение была выделена канонерская лодка "Черноморец". Начальником экспедиции назначен И. Б. Шпиндлер. Н. И. Андрусову поручено руководить геологическими и биологическими наблюдениями.
14 июня 1890 г. "Черноморец", подняв якорь, отправился в месячное плавание в центральные районы Черного моря. За месяц он прошел в разных направлениях свыше 2500 миль. Экспедиция была снабжена приборами для отбора проб со дна, измерения морских глубин, температуры и
солености воды на разных глубинах и др. Исследования показали, что дно центральной части Черного моря представляет собой ровную глубокую котловину. Не менее интересными оказались данные гидрологические и о донной фауне. Сенсационным было то, что ни первая, ни вторая, ни третья и никакая другая проба, взятая со дна, не принесла живых существ, сосуды лишь разносили запах сероводорода. Это неопровержимо доказывало, что глубины Черного моря безжизненны. Еще более неожиданными были находки в иле, поднятом с большой глубины (примерно 360—400 м): створки раковин моллюсков, исчезнувших в Черном море и ныне живущих в Каспийском. Они надежно свидетельствовал и, что в прошлом условия жизни в Черном море были другими.
Результаты этой экспедиции оказались настолько ободряющими, что в следующем году (1891) была организована вторая экспедиция, во время которой проводились детальные гидрологические исследования Черного моря. Было установлено, что во всех частях моря на глубинах более 200 м в воде содержится сероводород.
Обе русские глубомерные экспедиции, положив начало новому этапу в изучении Черного моря, имели огромное научное значение.